Czytaj książkę: «Второй геном: Руководство для владельца»

РУКОВОДСТВО ДЛЯ ВЛАДЕЛЬЦА

Второй геном

Научно. Без паники. Без советов.

Только логика, эволюция, факты.

Саша Сомс · Санкт-Петербург, 2026

Информация в книге носит ознакомительный характер и не является медицинской рекомендацией. При хронических заболеваниях и острых состояниях обращайтесь к врачу.

© Саша Сомс, 2026

Вопросы по книге: book@sashasoms.ru

Содержание

Введение

«Я вырос не в стерильных комнатах»

Часть 1. Я – не один. Эволюция симбиоза

– Откуда появились микробы? (происхождение жизни)

– Как микробы стали частью человека? (эндосимбиоз, ДНК митохондрий)

– Человек как гибрид: сколько микробных клеток и генов на самом деле

– Микробиота как «второй геном»

– От чашки Петри к «-омам»: как менялась сама наука о микробах

– Почему человек не может жить без них? (опыты на гнотобиотических животных)

– Где живут микробы: кишечник, кожа, рот, мочеполовая система, мозг

– Микробиота и иммунитет: обучение с рождения

Часть 2. Что сломалось? Цена «стерильного мира»

– Как цивилизация меняет микробиоту: ультрапереработанная пища, антибиотики, хлорированная вода, кесарево сечение, отсутствие контакта с почвой

– «Гигиеническая теория»: аллергии, аутоиммунные болезни и потеря микробов

– Почему йогурты и кефиры – не решение?

– Клизмы, «очищения»: что происходит с экосистемой кишечника?

Часть 3. Инфекция – не враг. Новый взгляд на болезни

– Какая доля хронических заболеваний имеет инфекционный след? (доказано / вероятно / гипотеза / опровергнуто)

– Не «лечить симптом», а искать возбудителя

– Примеры: H. pylori и язва, P. acnes и акне, Fusobacterium и рак толстой кишки

– Почему подавление одного микроба может уничтожить всю экосистему?

– Логика: не «убить врага», а «восстановить порядок»

Часть 4. Персонализация: будущее здоровья

– Почему один и тот же пробиотик может помочь одним и навредить другим?

– Анализ микробиоты: что можно узнать сегодня?

– Персонализированные пробиотики: уже есть (США, ЕС, РФ, Япония)

– Бактериальные трансплантаты (ТФМ) – как это работает?

– Твой микробный отпечаток

– Что теряется, если микробиота разрушена – и что можно сохранить, пока она цела

Часть 5. Питание – не про калории. Это про микробов

– Что едят микробы? (пребиотики: инулин, олигосахариды, клетчатка)

– Почему полезны ферментированные продукты? (но не все)

– Роль полифенолов, жиров, белков в балансировке микробиоты

– Как стресс и сон влияют на микробов?

– Почему «правильное питание» зависит от твоей микробиоты?

Часть 6. Любовь, разум, симбиоз

– Микробиота и мозг: ось «кишечник–мозг»

– Серотонин, дофамин, тревожность – кто на самом деле в этом участвует?

– Почему после еды хочется спать или общаться?

– Любовь как биологическое состояние: окситоцин, микробы партнёров

– Запах, дружба и социальная химия – при чём здесь микробы

Заключение. Сохрани себя. Сохрани своё

– Я – не хозяин, а управляющий экосистемой

– Будущее: персонализированная медицина, основанная на микробиоте

– Как каждый день меняет микробиоту

– Логика раздела: понимание вместо лечения, поддержка экосистемы вместо её очищения, свои штаммы вместо чужих

– Послание: ты – не один. И это твоя сила

PS. Практическая часть и приложение-справочник

Источники

ОТ АВТОРА

Я не учёный с детства. Но жизнь сделала меня биотехнологом

По большому счёту, я никогда не работал «по найму». Всегда верил: если хочешь чего-то по-настоящему – делай сам.

Я чувствовал: где-то там, за горизонтом, есть что-то большее – технологичное, живое, значимое. Так в 2018 году начался проект по аутопробиотикам и биобанкированию в компании «Микробиом». Строил его с нуля под ключ – буквально с пустого помещения. Плотно работал с профессором Александром Николаевичем Суворовым.

С 2021 года организовал и провёл три международные конференции по микробиоте человека и животных (HAM – Human and Animal Microbiota, 2020–2022) – да, даже в пандемию.

В том же 2021 году перевёз лабораторию «Авена» из тесного старого помещения в новое – отремонтированное с нуля, с полноценными стерильными зонами для выращивания знаменитой культуры энтерококка L3.

Дальше – путь, который продолжается по сей день: компания «А.Сомс Биотехнологии», партнёрство с Евгением Богдановым. Здесь – первый в мире патент на изобретение: применение штамма Enterococcus faecium EB9 (депонирован в ФГБНУ ВНИИСХМ, регистрационный номер RCAM07244) в виде лизата или супернатанта для улучшения и восстановления барьерной функции кожи. На подходе ещё два патента – на технологии защиты и доставки пробиотиков.

Сегодня я работаю сразу в нескольких направлениях. Они разные по задачам, но растут из одного корня – микробиоты:

– производство: полный цикл, пробиотические продукты питания и косметика, всё в Санкт-Петербурге;

– разработка косметических активов: ферментированные масла, лизаты, фильтраты;

– разработка питательных сред для криоконсервации: как заморозить живую культуру и не убить её при этом;

– биобанкирование микробиоты – моя главная задача здесь: сохранять как можно больше живых микроорганизмов, включая самые капризные, анаэробные, которые гибнут от контакта с кислородом за считаные минуты;

– растительные пептиды – для продуктов функционального питания и средств для кожи и волос.

Я – изобретатель. Придумываю, тестирую, ломаю, переделываю. У меня нет диплома биолога на стене, но есть лаборатории, которые я собрал с нуля, решения, которые работают, и опыт, выстраданный годами.

Кстати, о жизни вне лаборатории: спортом, кроме йоги и турника, я не занимаюсь, но много хожу пешком – а ещё у меня сын, который в два раза активнее любого спортзала! С ним – зарядка, коньки, велосипед, самокат, карате, творчество… Сидеть спокойно просто некогда.

Я верю: невозможное – возможно. Особенно когда делаешь не ради прибыли, а ради результата.

И если вы читаете это – значит, тоже ищете не просто «ещё один продукт», а решение, за которым стоит человек, а не маркетинг.

Добро пожаловать в мой мир. Здесь всё по-честному. И всё работает.

И ещё одна честная вещь напоследок: наука не стоит на месте. То, что вчера казалось точно доказанным, сегодня может немного измениться, а завтра – измениться ещё раз. Так устроена настоящая наука, и это нормально – я старался писать так, чтобы книга не устарела быстро, но какие-то детали со временем всё равно уточнятся.

Надеюсь, эта книга станет твоим добрым помощником – тем, к чему можно будет возвращаться снова и снова, когда появится новый вопрос. А дальше ты сам решишь: заглянуть сюда ещё раз или разобраться самостоятельно. И то, и другое – правильно.

МОЙ ПОДХОД

Эта книга написана по-другому

Эта книга устроена иначе, потому что в ней перевёрнут привычный взгляд на здоровье. Здесь нет готовых рецептов в духе «ешь так – и всё пройдёт». Вместо этого мы вместе пройдём по понятной цепочке:

факт → логика → осознание → выбор

Чтобы сложные процессы стали простыми, медицинские термины заменены живыми метафорами:

– вместо сухого «дисбиоз» – нарушение баланса;

– вместо аптечного «пребиотики» – пища для внутренних союзников.

В основе книги лежат строгие научные исследования, а не чужие мнения.

Но главная цель – не просто дать тебе новые знания, а помочь взглянуть на себя совершенно по-новому: как на живую, мудрую экосистему, а не как на механизм, в котором что-то сломалось.

Ведь только через понимание себя начинаются настоящие, осознанные изменения.

КРАТКИЙ СЛОВАРЬ

Два слова, с которых всё начинается

Микробиота – сообщество микроорганизмов (бактерий, грибов, вирусов, архей), живущих в организме человека: в кишечнике, на коже, в полости рта, в мочеполовой системе и других зонах. Это экосистема, а не случайные жильцы.

Микробиом – совокупность всех генов этих микроорганизмов. У каждого человека – свой микробиом, как отпечаток пальца. Он влияет на иммунитет, метаболизм, настроение, старение.

ВАЖНО

Я не называю микробов «хорошими» и «плохими». Я различаю патогенные, условно-патогенные и непатогенные. Даже потенциально опасные штаммы могут быть частью баланса – если их немного и если другие микробы их контролируют.

Нет плохих микробов. Есть нарушение баланса

Представь город. В нём живут полицейские, врачи, учителя, строители. Но есть и те, кто может нарушить порядок – если условия станут благоприятными. Так же и в теле.

город микробиоты: у каждого жителя своя роль

Условно-патогенные микробы – не враги. Они часть системы. Когда всё в порядке – они спят, не мешают, даже помогают. Но если разрушить защиту (антибиотики, стресс, плохое питание) – они просыпаются, размножаются, начинают действовать.

Проблема не в них. Проблема – в потере баланса.

Как в городе нельзя решить преступность, просто выгоняя всех подозрительных, так и в теле нельзя «очиститься» от микробов.

Полностью «зачистить» город от подозрительных элементов не получится – и от микробов тоже: даже стерильные лабораторные животные быстро заселяются заново. Логика та же, что в любой устойчивой системе: не искоренение, а распределение ролей, при котором никто не берёт верх.

ВВЕДЕНИЕ

«Я вырос не в стерильных комнатах»

Если бы ты жил 100 лет назад – ты бы не знал, что такое йогурт в упаковке. Но ты бы знал вкус квашеной капусты из погреба, запах плесени на хлебе, прохладу родниковой воды, и как пахнет земля после дождя. И всё это – живое. Всё это – микробы. А ты – часть этого мира. Не гость. Не хозяин. Участник.

Миллионы лет эволюции против 100 лет «цивилизации»

Человечество существует около 300 тысяч лет. Первые города – около 10 тысяч лет. Массовая урбанизация – последние 200 лет. Антибиотики, очищенная вода, консерванты, пластик – последние 100–150 лет.

Это значит: почти вся история человеческого вида прошла в мире, где микробы были повсюду – в том числе и внутри тела.

Человек не эволюционировал для жизни в стерильных условиях. Он эволюционировал, взаимодействуя с микробами:

– через грязные руки после сбора ягод;

– через воду из реки или колодца – да, иногда с паразитами, но и с тысячами полезных бактерий;

– через немытые овощи с огорода;

– через ферментированные продукты, которые готовили дома, а не на заводе;

– через контакт с животными, почвой, компостом, навозом.

Предки не выбирали пробиотики. Они жили среди микробов – и те становились частью их тела.

Микробиота – не опция. Это наследие выживания

Учёные называют микробиоту «забытым органом». Но точнее сказать: это первый орган человека.

Потому что без микробов организм не может переваривать клетчатку; без них иммунная система не учится распознавать «своё» и «чужое»; а клетки кишечника при участии микробов синтезируют значительную часть серотонина тела – правда, это в основном периферический пул, а не тот, что напрямую отвечает за настроение в мозге (подробный разбор – в Части 6).

Без микробов не формируется барьерная функция – кишечника, слизистых рта, носа, глаз и кожи – первая линия защиты от токсинов и патогенов.

Без них не вырабатывается часть ключевых витаминов – витамин К2, часть витаминов группы В (включая В12, фолиевую кислоту, биотин и рибофлавин), и отчасти усвоение витамина А из бета-каротина; точный вклад микробов в эти процессы и то, где проходит анатомическая граница между «синтезировано» и «усвоено», подробно разбирается в PS-разделе о витаминах.

Без микробов нарушается энергетический баланс – короткоцепочечные жирные кислоты (бутират, пропионат), которые они производят, питают клетки кишечника и участвуют в регуляции аппетита.

Без них снижается устойчивость к стрессу – микробы участвуют в регуляции оси «гипоталамус–гипофиз–надпочечники»; нарушается детоксикация – микробные ферменты помогают расщеплять ксенобиотики, лекарства, избыток эстрогенов.

Логика идёт дальше тела: способность существовать в устойчивом партнёрстве с другим организмом – то же самое умение «различать своё и чужое, не уничтожая», на котором держится иммунная толерантность. Прямая линия к «доверию» и «любви» – красивая параллель, а не доказанный факт; в Части 6 разберём, что из этого действительно подтверждено.

Все эти процессы формировались в условиях постоянного контакта с внешней средой. А сегодня ты живёшь в доме с УФ-очисткой, пьёшь бутилированную воду, ешь продукты с консервантами, моешься антибактериальным мылом.

Ты во многом отгородил себя от источника, который миллионы лет поддерживал твою биологию.

Что случилось с микромиром человека?

Сравним два мира: раньше и сейчас.

Раньше: Вода из реки, колодца, родника – с живой микрофлорой, бактериофагами, минералами. Постоянный источник микробного разнообразия.

Сейчас: Бутилированная, фильтрованная, хлорированная вода. Часто очищена глубоко (обратный осмос) и лишена части микроэлементов.

Раньше: Еда с огорода – с землёй, спорами, дрожжами. Капуста с грядки → квашение в бочке. Яблоки с дерева – с сердцевиной, где живут лактобактерии.

Сейчас: Продукты с консервантами, термообработанные, упакованные. Овощи моются почти до стерильности, фрукты обрабатываются антисептиками.

Ферментация: раньше и сейчас

Раньше: Ферментация – основа питания дома: квас, простокваша, кумыс, капуста, солёные грибы, ржаной хлеб на закваске, катык, кимчи, мисо – созданные дикими культурами.

Сейчас: Готовые йогурты, кетчупы, консервы содержат 3–5 стандартных штаммов, часто с сахаром и стабилизаторами – без живого контекста и экологической связи.

Роды: раньше и сейчас

Раньше: Роды естественным путём – ребёнок получает Lactobacillus и Bifidobacterium через родовые пути. Первый иммунный «запуск».

Сейчас: Кесарево сечение стало значительно чаще. Первичная колонизация ребёнка идёт от врачей, воздуха, поверхностей – риск аллергии, астмы и ожирения после кесарева обсуждается в исследованиях; подробный разбор, с учётом сопутствующих факторов, – в Части 2.

Вскармливание и контакт с природой

Раньше: Грудное вскармливание – норма, с молозива, богатого олигосахаридами (HMO), Bifidobacterium, антителами.

Сейчас: Смеси вместо грудного молока – без HMO, живых культур и бактериофагов; искусственные аналоги не воспроизводят сложность живой системы.

Раньше: Контакт с животными, землёй, природой – норма жизни: грязь на руках, ходьба босиком, погреб, компост.

Сейчас: Городская жизнь – линолеум, ламинат, бетон, дезинфекция, антибактериальные гели. Микробное разнообразие среды заметно снижено.

Средняя продолжительность жизни выросла – во многом благодаря медицине, санитарии, вакцинам. Но параллельно растёт частота диагностики аутоиммунных заболеваний (тиреоидит, диабет 1 типа, болезнь Крона) – точная динамика различается по странам и системам учёта.

Растёт и частота диагностики ожирения, депрессии, СДВГ – причины множественные, потеря микробного разнообразия обсуждается как одна из линий, не единственная. Часть исследователей связывает часть этой динамики именно с ней – гипотеза активно изучается.

Ты не стал чище. Ты стал беднее

Когда ты говоришь «стерильность», ты думаешь «чистота». Но с точки зрения биологии стерильность – это экологическая пустота.

Представь лес, выжженный огнём. Там нет вредных видов. Но нет и полезных. Нет баланса. Нет восстановления.

Похожая динамика разворачивается в кишечнике после курса антибиотиков, после клизм и «очищений», после долгого рациона без живых культур: теряются не просто отдельные микробы, а функции, которые они выполняли – сдерживание патогенов, производство части витаминов, защита слизистой, обучение иммунитета, влияние на настроение.

Вернуться к будущему

Я не призываю вернуться в пещеры. Технический прогресс не отменил биологию – он просто перенёс её в новые декорации.

Современные технологии – секвенирование ДНК, метагеномика, персонализированные пробиотики – позволяют понять и восстановить то, что было потеряно. Не ради ностальгии, а ради того, чтобы биология и цивилизация работали вместе, а не вопреки друг другу.

Будущее здоровья – не только в новых лекарствах. Оно и в возвращении к себе. К своему микробному «я». К тому, чем ты был миллионы лет.

Часть 1. Я – не один. Эволюция симбиоза

Человек не начался с разума. Он начался с микроба – и с кишечника логичнее начинать рассказ о происхождении, чем с мозга. Он – результат миллиардов лет совместной эволюции.

Откуда появились микробы? Происхождение жизни

Первые живые существа на Земле – археи и бактерии – появились около 3,8 миллиарда лет назад. Долгое время они были единственными формами жизни.

Они жили в океанах, возле гидротермальных источников, получали энергию не от света, а от химических реакций, и создавали условия для появления кислорода, воды, органики.

Цианобактерии – один из ключевых источников кислорода в атмосфере Земли (Великое кислородное событие, около 2,4 млрд лет назад); формирование почвы и современной атмосферы – процессы с множеством факторов, где микробы сыграли важную, но не единственную роль.

И когда появились многоклеточные организмы, микробы уже были повсюду. И стали не помехой, а партнёрами.